Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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