Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Scarb2O35114 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Scarb2O35114 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Scarb2O35114 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
Scarb2O35114 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Scarb2O35114 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
Scarb2O35114 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.58□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Scarb2O35114 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Scarb2O35114 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Scarb2O35114 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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