Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cldn4O35054 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cldn4O35054 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cldn4O35054 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cldn4O35054 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cldn4O35054 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cldn4O35054 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cldn4O35054 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cldn4O35054 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cldn4O35054 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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