Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
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Gm379J3QQ19 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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Gm379J3QQ19 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Gm379J3QQ19 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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Gm379J3QQ19 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
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Gm379J3QQ19 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
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Gm379J3QQ19 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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Gm379J3QQ19 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Gm379J3QQ19 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Gm379J3QQ19 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Gm379J3QQ19 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Gm379J3QQ19 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Gm379J3QQ19 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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Gm379J3QQ19 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Gm379J3QQ19 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
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Gm379J3QQ19 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Gm379J3QQ19 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Gm379J3QQ19 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Gm379J3QQ19 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Gm379J3QQ19 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Gm379J3QQ19 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Gm379J3QQ19 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
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