Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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