Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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