Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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