Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.9 ms