Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 770.3 ms