Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Sh3bp1P55194 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms