Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ggta1P23336 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms