Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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