Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Opn1mwO35599 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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