Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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