Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm25870-201ENSMUST00000179845 79 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Gm3250E9Q1M3 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm24725-201ENSMUST00000158229 125 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm22474-201ENSMUST00000179407 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms