Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nphp1Q9QY53 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nphp1Q9QY53 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nphp1Q9QY53 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nphp1Q9QY53 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Nphp1Q9QY53 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Nphp1Q9QY53 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Nphp1Q9QY53 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Nphp1Q9QY53 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Nphp1Q9QY53 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms