Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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