Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Csmd3-204ENSMUST00000160658 12460 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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