Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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Chmp3Q9CQ10 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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Chmp3Q9CQ10 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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Chmp3Q9CQ10 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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