Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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Pggt1bQ8BUY9 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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Pggt1bQ8BUY9 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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