Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Vipas39Q8BGQ1 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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Vipas39Q8BGQ1 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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Vipas39Q8BGQ1 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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Vipas39Q8BGQ1 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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Vipas39Q8BGQ1 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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Vipas39Q8BGQ1 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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