Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc18Q640L5 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Ccdc18Q640L5 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc18Q640L5 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc18Q640L5 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc18Q640L5 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc18Q640L5 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc18Q640L5 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc18Q640L5 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms