Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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Cln5Q3UMW8 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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Cln5Q3UMW8 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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Cln5Q3UMW8 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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Cln5Q3UMW8 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln5Q3UMW8 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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