Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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Spatc1Q148B6 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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Spatc1Q148B6 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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Spatc1Q148B6 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
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Spatc1Q148B6 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Spatc1Q148B6 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Spatc1Q148B6 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Spatc1Q148B6 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Spatc1Q148B6 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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Spatc1Q148B6 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Spatc1Q148B6 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Spatc1Q148B6 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Spatc1Q148B6 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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Spatc1Q148B6 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Spatc1Q148B6 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Spatc1Q148B6 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Spatc1Q148B6 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Spatc1Q148B6 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Spatc1Q148B6 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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