Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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Sh3bp1P55194 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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Sh3bp1P55194 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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Sh3bp1P55194 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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