Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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Ccl20O89093 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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Ccl20O89093 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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Ccl20O89093 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
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Ccl20O89093 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccl20O89093 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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