Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm24456-201ENSMUST00000083198 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm24458-201ENSMUST00000083204 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm25790-201ENSMUST00000083293 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm22295-201ENSMUST00000083311 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm25127-201ENSMUST00000083336 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm25583-201ENSMUST00000083413 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm25577-201ENSMUST00000083414 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm24414-201ENSMUST00000083434 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm24861-201ENSMUST00000083459 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm24803-201ENSMUST00000083693 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm22580-201ENSMUST00000083727 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm24260-201ENSMUST00000083741 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm22682-201ENSMUST00000083854 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm25869-201ENSMUST00000083855 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm24693-201ENSMUST00000083885 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ldb2O55203 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms