Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn4O35054 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.7 ms