Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MttpO08601 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
MttpO08601 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MttpO08601 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MttpO08601 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MttpO08601 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MttpO08601 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MttpO08601 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MttpO08601 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
MttpO08601 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MttpO08601 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MttpO08601 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MttpO08601 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MttpO08601 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
MttpO08601 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MttpO08601 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MttpO08601 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MttpO08601 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MttpO08601 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
MttpO08601 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MttpO08601 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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MttpO08601 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MttpO08601 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MttpO08601 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MttpO08601 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MttpO08601 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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