Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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Ccdc171E9Q1U1 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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Ccdc171E9Q1U1 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms