Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc8D3YZV8 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc8D3YZV8 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.5 ms