Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col5a3Q9JLI2 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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