Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cldn19Q9ET38 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms