Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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