Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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Chmp3Q9CQ10 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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Chmp3Q9CQ10 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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Chmp3Q9CQ10 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Chmp3Q9CQ10 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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Chmp3Q9CQ10 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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Chmp3Q9CQ10 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Chmp3Q9CQ10 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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