Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Dsg1bQ7TSF1 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms