Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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Cln5Q3UMW8 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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Cln5Q3UMW8 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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Cln5Q3UMW8 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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Cln5Q3UMW8 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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Cln5Q3UMW8 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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Cln5Q3UMW8 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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Cln5Q3UMW8 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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Cln5Q3UMW8 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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Cln5Q3UMW8 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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Cln5Q3UMW8 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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Cln5Q3UMW8 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln5Q3UMW8 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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