Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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Ssbp4Q3U4B1 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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Ssbp4Q3U4B1 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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Ssbp4Q3U4B1 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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