Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spatc1Q148B6 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms