Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.1 ms