Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd10P28359 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd10P28359 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms