Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ggta1P23336 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms