Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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