Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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Opn1mwO35599 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Opn1mwO35599 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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