Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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Cldn4O35054 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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Cldn4O35054 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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Cldn4O35054 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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Cldn4O35054 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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Cldn4O35054 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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