Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm45031-201ENSMUST00000206800 288 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm27535-201ENSMUST00000183814 157 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC4.28□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.4 ms