Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Grik3B1AS29 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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