Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Col5a3Q9JLI2 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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