Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 AC123035.1-201ENSMUST00000213846 2671 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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