Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
Usp38Q8BW70 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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